Lis pierwsze piłkarskie kroki stawiał w Promieniu Żary. Następnie trafił do młodzieżowych zespołów UKP Zielona Góra. W sezonie 2013/14 dołączył do Lecha Poznań, gdzie przede wszystkim występował w II drużynie, a także trenował z seniorskim zespołem "Kolejorza". W międzyczasie nasz nowy zawodnik został wypożyczony do Miedzi Legnica. 

Ostatnie pół roku Lis spędził w Podbeskidziu Bielsko-Biała, gdzie wystąpił w 4. meczach pierwszoligowca (3 na zapleczu Ekstraklasy, 1 w Pucharze Polski). Młody golkiper z dużymi nadziejami przychodzi do naszego klubu. - Liczę, że uda nam się podtrzymać dobrą passę z rundy jesiennej i zakończyć sezon na miejscu premiowanym awansem do pierwszej ligi. Ja ze swojej strony mogę zapewnić, że zrobię wszystko żeby tak się stało. Zdaję sobie sprawę, że o miejsce w bramce Rakowa nie będzie łatwo, ale nie boję się rywalizacji, bo dzięki niej wszyscy podnosimy swoje umiejętności - powiedział po podpisaniu kontraktu Mateusz Lis. 

Wypożyczenie tego piłkarza to drugi transfer do Rakowa przed rundą wiosenną. Wcześniej umowę z RKS-em parafował Tomasz Wróbel.